У Rainbow Six Extraction гравцям належить приєднатися до команди REACT і зібрати свій загін (1-3 особи) з усіх улюблених оперативників Rainbow Six Облога, щоб кинути виклик таємничим інопланетним істотам, відомим як археї. Після виконання кожного завдання гравці повинні зробити непростий вибір: евакуюватися, забравши зароблені нагороди, або йти до наступної частини зони, де вороги будуть сильнішими, а нагороди — кращими. Чим далі, тим більше хаосу та напруження. В результаті гравці можуть тимчасово втратити одного зі своїх оперативників, якщо його захоплять ворога в зоні ізоляції і потрапить до списку зниклих безвісти. Щоб повернути зниклого, гравцям доведеться організувати ризиковану рятувальну операцію.